在业余球会Clube Atletico Paulistano赢得一些桂冠之后，遭逢巴西足球联赛的职业化，球会却决议退出足球运动，当时另一支球会Associacao Atletica das Palmeiras也是有同样的决议。所以两队的球员和球迷就在1930年共同成立了Sao Paulo Futebol Clube，是为今日圣保罗的前身。新球会在1933年首度参加巴西职业足球联赛，他们第一场就以5-1击败桑托斯。
       不过新球会好景不常，因为董事会欠下了大笔债务，所以球会决议在1935年和Clube de Regatas Tiete合并，而足球的赛事也停止参加。就在球会被合并不久后，当时的Clube Atletico Sao Paulo创办人又创造一支名为Gremio Tricolor的队伍，这支队伍后来改名为Sao Paulo Futebol Clube，就这样，今日的圣保罗足球会在1935成型。
       圣保罗的重生非常受到瞩目，不过实力却很弱。由于球会投注心力于莫隆比球场的建设，所以不肯花费大笔资金于球员的购买。在1960年莫隆比球场终于落成，1970年莫隆比球场进行修改和扩充。之后球队获得两次圣保罗洲冠军。1971年，圣保罗第一次排名巴西全国足球联赛第二名，他们排在米涅罗竞技之后。1974年，圣保罗争议性的在南美解放者杯决赛重赛中，负于阿根廷的独立队。1977年首次成功夺下巴西全国足球联赛冠军。
       在上世纪80年代圣保罗赢得了为数相当可观的奖杯，1990年俱乐部聘请特莱·桑塔纳为主教练，1991年，已经连续两年是巴西全国足球联赛亚军的圣保罗，第三度夺下这项联赛的冠军殊荣；1992年，圣保罗队在南美解放者杯决赛中击败来自阿根廷的纽维尔旧生。1992年的圣保罗除了解放者杯外，更在东京的洲际杯称霸，这也是队史上第一座洲际杯。它们以2-1击败了克鲁伊夫率领的巴塞罗那。回国之后，圣保罗击败帕尔梅拉斯成为圣保罗省冠军杯冠军。
       由于健康因素，特莱·桑塔纳在1996年离队，他为圣保罗带来的黄金年代也宣告结束。其后，著名球星切尼、卡福、西西尼奥、卡卡和法比亚诺挑起了圣保罗大梁，2005年12月，圣保罗在世界俱乐部杯决赛中以1-0击败英超的利物浦，这是圣保罗第三次夺得洲际足球冠军，重新登上了世界顶端，也成为第一支三次闯入世界俱乐部杯(前丰田杯)赛事的巴西俱乐部。

       巴甲联赛冠军：1977，1986，1991，2006，2007，2008。
       圣保罗洲冠军：1931，1943，1945，1946，1948，1949，1953，1957，1970，1971，1975，1980，1981，1985，1987，1989，1991，1992，1998，2000，2005。
       南美自由杯冠军：1992，1993，2005。
       世界俱乐部杯：1992，1993，2005。